MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	CATTT	2	10	806	815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021517	AAC	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021517	ATTA	2	8	1091	1098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021517	AACTA	2	10	1166	1175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021517	ATT	2	6	1240	1245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021517	ATA	2	6	1248	1253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021517	GCT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021517	AAG	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021517	CTT	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021517	TAAT	2	8	1332	1339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021517	A	6	6	1384	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021517	T	6	6	1443	1448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021517	ACC	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021517	AAT	2	6	1513	1518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021517	GATAA	2	10	1523	1532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021517	A	6	6	1531	1536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021517	A	6	6	1544	1549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021517	CCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021517	ACC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021517	TATT	2	8	2268	2275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021517	AGC	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021517	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021517	ATGTAT	2	12	2551	2562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021517	TTA	2	6	2588	2593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021517	CTTA	2	8	2617	2624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021517	GAG	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021517	TG	4	8	3475	3482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021517	AGG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021517	G	6	6	3761	3766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021517	GTT	2	6	3768	3773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021517	TTGC	2	8	3801	3808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021517	A	6	6	3851	3856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021517	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021517	AAC	2	6	4194	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021517	T	6	6	4451	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021517	GTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021517	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021517	TTGTA	2	10	4574	4583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021517	CT	3	6	4607	4612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021517	GT	3	6	4624	4629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021517	AGCTG	2	10	5878	5887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021517	A	6	6	5888	5893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021517	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021517	AAT	2	6	6645	6650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021517	CTTT	2	8	6659	6666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021517	AAT	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021517	ATGA	2	8	6759	6766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021517	TCC	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021517	ATC	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021517	AAT	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021517	CAG	2	6	7423	7428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021517	TGT	2	6	7477	7482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021517	ACA	2	6	7523	7528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021517	CAAAG	2	10	7547	7556	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021517	ATA	2	6	9685	9690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021517	GGCA	2	8	10584	10591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021517	AAT	2	6	10624	10629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021517	TCC	2	6	10661	10666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021517	GCTA	2	8	10695	10702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021517	GCG	2	6	10717	10722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021517	TGATG	2	10	10784	10793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021517	TTG	2	6	10807	10812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021517	CAA	2	6	10891	10896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021517	TA	3	6	10963	10968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021517	GCG	2	6	10989	10994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021517	TAT	2	6	11021	11026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021517	CA	3	6	11042	11047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021517	CGG	3	9	11068	11076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021517	GTC	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021517	G	10	10	15700	15709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021517	GC	3	6	15772	15777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021517	CT	3	6	15791	15796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021517	GGT	2	6	15806	15811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021517	GAC	2	6	15865	15870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021517	GGCA	2	8	15874	15881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021517	TGA	2	6	15906	15911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021517	CGC	3	9	15943	15951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021517	ACC	2	6	15956	15961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021517	TGG	2	6	15968	15973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021517	T	6	6	17311	17316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021517	AGG	2	6	17697	17702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021517	CATTT	2	10	18914	18923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021517	TTTA	2	8	18964	18971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021517	A	6	6	19018	19023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021517	ATT	2	6	19034	19039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021517	TAA	2	6	19064	19069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021517	CAAA	2	8	19093	19100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021517	TTA	2	6	19114	19119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021517	TTG	2	6	19163	19168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021517	GTG	2	6	19199	19204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021517	A	8	8	19219	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021517	A	7	7	19240	19246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021517	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021517	AGGT	2	8	19684	19691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021517	T	6	6	19691	19696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021517	AAT	2	6	19706	19711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021517	GA	3	6	19719	19724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021517	TA	3	6	19743	19748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021517	ATT	2	6	19783	19788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021517	GCCA	2	8	19818	19825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021517	CCA	2	6	19845	19850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021517	GCAGT	2	10	19860	19869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021517	AGT	2	6	19892	19897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021517	GAT	2	6	23692	23697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021517	CTT	2	6	23699	23704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021517	TAA	2	6	23708	23713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021517	A	7	7	23728	23734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021517	AAAT	2	8	23882	23889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021517	TAA	2	6	23903	23908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021517	GCT	2	6	24649	24654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021517	GTT	2	6	24682	24687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021517	CGATAA	2	12	24732	24743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021517	TGG	2	6	24789	24794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021517	TTCC	2	8	25091	25098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021517	GA	3	6	25103	25108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021517	CT	3	6	25127	25132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021517	TCA	2	6	25194	25199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021517	A	6	6	25229	25234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021517	T	6	6	25289	25294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021517	GATA	2	8	25342	25349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021517	TCA	2	6	25354	25359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021517	TAA	2	6	25429	25434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021517	T	8	8	25446	25453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021517	AAC	2	6	25669	25674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021517	CAAT	2	8	25683	25690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021517	AACG	2	8	25704	25711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021517	T	6	6	26470	26475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021517	TCTAA	2	10	26519	26528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021517	ATA	2	6	26644	26649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021517	A	7	7	26656	26662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021517	GTT	2	6	28451	28456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021517	TTG	2	6	28465	28470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021517	TTTTA	2	10	31656	31665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021517	TAT	2	6	31696	31701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021517	TGA	2	6	31734	31739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021517	ACT	2	6	31831	31836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021517	TTA	2	6	31952	31957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021517	AT	3	6	31966	31971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021517	AGC	2	6	31976	31981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021517	CAT	2	6	32053	32058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021517	TCTT	2	8	32089	32096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021517	CAA	2	6	32885	32890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021517	AACT	2	8	32941	32948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021517	TGAT	2	8	32966	32973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021517	ACG	2	6	32976	32981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021517	A	6	6	33073	33078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021517	ATT	2	6	33097	33102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021517	T	6	6	33112	33117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021517	T	6	6	33124	33129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021517	CCA	2	6	33132	33137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_021517	ATC	2	6	33148	33153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021517	TA	3	6	33253	33258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021517	TA	4	8	33285	33292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021517	GAT	2	6	33303	33308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021517	ACA	2	6	35992	35997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021517	CTAA	2	8	36034	36041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_021517	TCCC	2	8	37978	37985	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_021517	AGGA	2	8	37998	38005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021517	ATA	2	6	38681	38686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021517	AACGAA	2	12	38770	38781	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_021517	AACA	2	8	38787	38794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021517	G	6	6	38807	38812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021517	ATA	2	6	38895	38900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021517	T	7	7	38931	38937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021517	AAT	2	6	39004	39009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021517	T	6	6	39049	39054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021517	TAAG	2	8	39102	39109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021517	TAAT	2	8	39378	39385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021517	ACG	2	6	39391	39396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021517	TTA	2	6	39409	39414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021517	GA	3	6	39424	39429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021517	ATTT	2	8	39431	39438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021517	TGT	2	6	39464	39469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021517	TAC	2	6	39504	39509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021517	TAT	2	6	39615	39620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021517	ATG	2	6	39628	39633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021517	AGG	2	6	39736	39741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021517	ATGA	2	8	39750	39757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021517	CAC	2	6	39819	39824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_021517	GCT	2	6	39845	39850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_021517	TAA	2	6	39914	39919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021517	AACTT	2	10	39964	39973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_021517	AAC	2	6	40052	40057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_021517	CTG	2	6	40090	40095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_021517	ACT	2	6	40132	40137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.